Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE6DO43924 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE6DO43924 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE6DO43924 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE6DO43924 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE6DO43924 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE6DO43924 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE6DO43924 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE6DO43924 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE6DO43924 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE6DO43924 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE6DO43924 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE6DO43924 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE6DO43924 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE6DO43924 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE6DO43924 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE6DO43924 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE6DO43924 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE6DO43924 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE6DO43924 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE6DO43924 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE6DO43924 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE6DO43924 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE6DO43924 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE6DO43924 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE6DO43924 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE6DO43924 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE6DO43924 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE6DO43924 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE6DO43924 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE6DO43924 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE6DO43924 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE6DO43924 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE6DO43924 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE6DO43924 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE6DO43924 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE6DO43924 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE6DO43924 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE6DO43924 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE6DO43924 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE6DO43924 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDE6DO43924 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE6DO43924 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE6DO43924 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE6DO43924 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE6DO43924 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE6DO43924 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE6DO43924 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE6DO43924 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE6DO43924 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE6DO43924 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE6DO43924 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE6DO43924 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE6DO43924 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE6DO43924 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE6DO43924 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE6DO43924 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE6DO43924 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE6DO43924 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE6DO43924 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE6DO43924 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE6DO43924 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE6DO43924 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE6DO43924 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE6DO43924 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE6DO43924 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE6DO43924 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE6DO43924 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE6DO43924 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE6DO43924 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE6DO43924 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE6DO43924 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE6DO43924 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE6DO43924 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE6DO43924 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE6DO43924 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE6DO43924 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PDE6DO43924 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE6DO43924 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE6DO43924 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE6DO43924 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE6DO43924 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE6DO43924 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE6DO43924 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE6DO43924 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE6DO43924 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PDE6DO43924 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE6DO43924 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE6DO43924 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE6DO43924 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE6DO43924 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE6DO43924 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE6DO43924 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE6DO43924 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE6DO43924 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE6DO43924 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE6DO43924 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE6DO43924 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE6DO43924 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE6DO43924 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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