Protein–RNA interactions for Protein: O43918

AIRE, Autoimmune regulator, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIREO43918 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AIREO43918 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AIREO43918 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AIREO43918 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AIREO43918 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AIREO43918 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AIREO43918 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AIREO43918 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AIREO43918 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AIREO43918 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AIREO43918 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AIREO43918 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AIREO43918 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AIREO43918 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AIREO43918 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AIREO43918 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AIREO43918 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AIREO43918 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
AIREO43918 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AIREO43918 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AIREO43918 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AIREO43918 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AIREO43918 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AIREO43918 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AIREO43918 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AIREO43918 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AIREO43918 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AIREO43918 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AIREO43918 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AIREO43918 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AIREO43918 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AIREO43918 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AIREO43918 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AIREO43918 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AIREO43918 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AIREO43918 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AIREO43918 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AIREO43918 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AIREO43918 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AIREO43918 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AIREO43918 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AIREO43918 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AIREO43918 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AIREO43918 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AIREO43918 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AIREO43918 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AIREO43918 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AIREO43918 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AIREO43918 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AIREO43918 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AIREO43918 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AIREO43918 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AIREO43918 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
AIREO43918 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AIREO43918 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AIREO43918 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AIREO43918 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AIREO43918 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AIREO43918 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AIREO43918 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AIREO43918 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AIREO43918 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AIREO43918 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AIREO43918 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AIREO43918 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AIREO43918 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AIREO43918 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AIREO43918 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AIREO43918 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AIREO43918 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AIREO43918 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AIREO43918 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AIREO43918 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AIREO43918 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AIREO43918 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
AIREO43918 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AIREO43918 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AIREO43918 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AIREO43918 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AIREO43918 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AIREO43918 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AIREO43918 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AIREO43918 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AIREO43918 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AIREO43918 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AIREO43918 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AIREO43918 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AIREO43918 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AIREO43918 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AIREO43918 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AIREO43918 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AIREO43918 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AIREO43918 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AIREO43918 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AIREO43918 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AIREO43918 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AIREO43918 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AIREO43918 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AIREO43918 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AIREO43918 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms