Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSNA1O43805 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSNA1O43805 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSNA1O43805 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSNA1O43805 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSNA1O43805 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SSNA1O43805 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSNA1O43805 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSNA1O43805 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSNA1O43805 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSNA1O43805 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSNA1O43805 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSNA1O43805 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSNA1O43805 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSNA1O43805 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSNA1O43805 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSNA1O43805 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSNA1O43805 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSNA1O43805 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSNA1O43805 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSNA1O43805 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SSNA1O43805 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSNA1O43805 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSNA1O43805 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSNA1O43805 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSNA1O43805 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSNA1O43805 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSNA1O43805 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSNA1O43805 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSNA1O43805 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSNA1O43805 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SSNA1O43805 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSNA1O43805 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSNA1O43805 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSNA1O43805 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSNA1O43805 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSNA1O43805 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSNA1O43805 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSNA1O43805 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSNA1O43805 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSNA1O43805 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSNA1O43805 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSNA1O43805 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSNA1O43805 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSNA1O43805 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSNA1O43805 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSNA1O43805 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSNA1O43805 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSNA1O43805 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSNA1O43805 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSNA1O43805 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSNA1O43805 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSNA1O43805 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSNA1O43805 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSNA1O43805 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSNA1O43805 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSNA1O43805 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSNA1O43805 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSNA1O43805 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSNA1O43805 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSNA1O43805 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSNA1O43805 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSNA1O43805 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSNA1O43805 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSNA1O43805 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSNA1O43805 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSNA1O43805 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSNA1O43805 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSNA1O43805 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSNA1O43805 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSNA1O43805 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSNA1O43805 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSNA1O43805 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSNA1O43805 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSNA1O43805 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSNA1O43805 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSNA1O43805 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSNA1O43805 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSNA1O43805 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSNA1O43805 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSNA1O43805 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSNA1O43805 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSNA1O43805 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSNA1O43805 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSNA1O43805 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSNA1O43805 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSNA1O43805 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSNA1O43805 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSNA1O43805 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSNA1O43805 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSNA1O43805 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSNA1O43805 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSNA1O43805 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSNA1O43805 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSNA1O43805 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSNA1O43805 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSNA1O43805 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSNA1O43805 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSNA1O43805 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSNA1O43805 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms