Protein–RNA interactions for Protein: O43435

TBX1, T-box transcription factor TBX1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX1O43435 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TBX1O43435 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TBX1O43435 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TBX1O43435 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TBX1O43435 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TBX1O43435 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TBX1O43435 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TBX1O43435 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TBX1O43435 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TBX1O43435 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TBX1O43435 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TBX1O43435 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TBX1O43435 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TBX1O43435 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TBX1O43435 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TBX1O43435 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TBX1O43435 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TBX1O43435 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TBX1O43435 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TBX1O43435 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TBX1O43435 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TBX1O43435 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TBX1O43435 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TBX1O43435 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TBX1O43435 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TBX1O43435 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TBX1O43435 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TBX1O43435 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TBX1O43435 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TBX1O43435 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TBX1O43435 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TBX1O43435 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TBX1O43435 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TBX1O43435 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TBX1O43435 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TBX1O43435 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TBX1O43435 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TBX1O43435 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TBX1O43435 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TBX1O43435 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TBX1O43435 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TBX1O43435 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TBX1O43435 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TBX1O43435 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TBX1O43435 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TBX1O43435 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TBX1O43435 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TBX1O43435 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TBX1O43435 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TBX1O43435 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TBX1O43435 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TBX1O43435 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TBX1O43435 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TBX1O43435 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TBX1O43435 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TBX1O43435 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TBX1O43435 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TBX1O43435 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TBX1O43435 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TBX1O43435 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TBX1O43435 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TBX1O43435 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TBX1O43435 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TBX1O43435 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TBX1O43435 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TBX1O43435 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TBX1O43435 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TBX1O43435 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TBX1O43435 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TBX1O43435 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TBX1O43435 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TBX1O43435 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TBX1O43435 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TBX1O43435 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TBX1O43435 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TBX1O43435 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TBX1O43435 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TBX1O43435 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TBX1O43435 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TBX1O43435 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TBX1O43435 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TBX1O43435 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TBX1O43435 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TBX1O43435 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TBX1O43435 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TBX1O43435 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TBX1O43435 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TBX1O43435 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TBX1O43435 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TBX1O43435 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TBX1O43435 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TBX1O43435 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TBX1O43435 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TBX1O43435 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TBX1O43435 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TBX1O43435 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TBX1O43435 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TBX1O43435 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TBX1O43435 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TBX1O43435 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms