Protein–RNA interactions for Protein: O15499

GSC2, Homeobox protein goosecoid-2, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSC2O15499 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GSC2O15499 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GSC2O15499 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GSC2O15499 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GSC2O15499 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GSC2O15499 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GSC2O15499 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GSC2O15499 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GSC2O15499 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GSC2O15499 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GSC2O15499 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GSC2O15499 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GSC2O15499 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GSC2O15499 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GSC2O15499 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GSC2O15499 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GSC2O15499 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GSC2O15499 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GSC2O15499 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GSC2O15499 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GSC2O15499 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GSC2O15499 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GSC2O15499 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GSC2O15499 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GSC2O15499 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GSC2O15499 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GSC2O15499 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GSC2O15499 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GSC2O15499 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GSC2O15499 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GSC2O15499 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GSC2O15499 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GSC2O15499 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GSC2O15499 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GSC2O15499 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GSC2O15499 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GSC2O15499 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GSC2O15499 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GSC2O15499 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GSC2O15499 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GSC2O15499 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GSC2O15499 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GSC2O15499 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GSC2O15499 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GSC2O15499 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GSC2O15499 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GSC2O15499 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GSC2O15499 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GSC2O15499 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GSC2O15499 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GSC2O15499 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GSC2O15499 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GSC2O15499 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GSC2O15499 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GSC2O15499 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GSC2O15499 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GSC2O15499 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GSC2O15499 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GSC2O15499 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GSC2O15499 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GSC2O15499 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GSC2O15499 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GSC2O15499 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GSC2O15499 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GSC2O15499 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GSC2O15499 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GSC2O15499 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GSC2O15499 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GSC2O15499 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GSC2O15499 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GSC2O15499 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GSC2O15499 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GSC2O15499 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GSC2O15499 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GSC2O15499 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GSC2O15499 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GSC2O15499 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GSC2O15499 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GSC2O15499 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GSC2O15499 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GSC2O15499 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GSC2O15499 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GSC2O15499 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GSC2O15499 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GSC2O15499 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GSC2O15499 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GSC2O15499 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GSC2O15499 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GSC2O15499 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GSC2O15499 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GSC2O15499 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GSC2O15499 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GSC2O15499 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GSC2O15499 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GSC2O15499 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GSC2O15499 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GSC2O15499 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GSC2O15499 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GSC2O15499 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GSC2O15499 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1142.5 ms