Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASKO14936 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASKO14936 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASKO14936 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASKO14936 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASKO14936 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASKO14936 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASKO14936 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASKO14936 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASKO14936 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASKO14936 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASKO14936 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASKO14936 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASKO14936 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASKO14936 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASKO14936 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASKO14936 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASKO14936 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASKO14936 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASKO14936 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASKO14936 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASKO14936 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASKO14936 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASKO14936 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASKO14936 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CASKO14936 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASKO14936 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASKO14936 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASKO14936 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASKO14936 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASKO14936 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASKO14936 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASKO14936 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASKO14936 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASKO14936 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASKO14936 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASKO14936 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASKO14936 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASKO14936 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASKO14936 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASKO14936 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASKO14936 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASKO14936 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASKO14936 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASKO14936 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASKO14936 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASKO14936 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASKO14936 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASKO14936 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASKO14936 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASKO14936 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASKO14936 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASKO14936 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASKO14936 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASKO14936 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASKO14936 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASKO14936 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASKO14936 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASKO14936 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASKO14936 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASKO14936 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASKO14936 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CASKO14936 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASKO14936 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASKO14936 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASKO14936 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASKO14936 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASKO14936 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASKO14936 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASKO14936 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CASKO14936 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASKO14936 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASKO14936 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASKO14936 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASKO14936 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASKO14936 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASKO14936 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CASKO14936 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASKO14936 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CASKO14936 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASKO14936 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASKO14936 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASKO14936 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASKO14936 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASKO14936 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASKO14936 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASKO14936 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASKO14936 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASKO14936 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASKO14936 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASKO14936 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASKO14936 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASKO14936 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASKO14936 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASKO14936 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASKO14936 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASKO14936 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASKO14936 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASKO14936 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASKO14936 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms