Protein–RNA interactions for Protein: O14656

TOR1A, Torsin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR1AO14656 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOR1AO14656 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOR1AO14656 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOR1AO14656 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOR1AO14656 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOR1AO14656 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOR1AO14656 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOR1AO14656 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOR1AO14656 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOR1AO14656 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOR1AO14656 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOR1AO14656 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TOR1AO14656 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOR1AO14656 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOR1AO14656 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOR1AO14656 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOR1AO14656 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOR1AO14656 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOR1AO14656 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOR1AO14656 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOR1AO14656 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOR1AO14656 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TOR1AO14656 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOR1AO14656 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOR1AO14656 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOR1AO14656 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOR1AO14656 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOR1AO14656 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOR1AO14656 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOR1AO14656 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TOR1AO14656 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOR1AO14656 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOR1AO14656 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOR1AO14656 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TOR1AO14656 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOR1AO14656 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TOR1AO14656 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOR1AO14656 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOR1AO14656 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOR1AO14656 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOR1AO14656 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOR1AO14656 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOR1AO14656 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOR1AO14656 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOR1AO14656 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOR1AO14656 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOR1AO14656 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOR1AO14656 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOR1AO14656 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOR1AO14656 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOR1AO14656 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOR1AO14656 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOR1AO14656 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOR1AO14656 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOR1AO14656 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOR1AO14656 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TOR1AO14656 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TOR1AO14656 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOR1AO14656 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOR1AO14656 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOR1AO14656 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOR1AO14656 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOR1AO14656 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOR1AO14656 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOR1AO14656 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOR1AO14656 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOR1AO14656 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOR1AO14656 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOR1AO14656 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOR1AO14656 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOR1AO14656 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOR1AO14656 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOR1AO14656 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOR1AO14656 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOR1AO14656 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TOR1AO14656 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TOR1AO14656 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOR1AO14656 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOR1AO14656 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOR1AO14656 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOR1AO14656 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOR1AO14656 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOR1AO14656 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOR1AO14656 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOR1AO14656 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOR1AO14656 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOR1AO14656 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOR1AO14656 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TOR1AO14656 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOR1AO14656 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOR1AO14656 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOR1AO14656 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOR1AO14656 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOR1AO14656 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOR1AO14656 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOR1AO14656 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOR1AO14656 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOR1AO14656 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOR1AO14656 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOR1AO14656 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms