Protein–RNA interactions for Protein: O00421

CCRL2, C-C chemokine receptor-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCRL2O00421 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCRL2O00421 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCRL2O00421 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCRL2O00421 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCRL2O00421 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCRL2O00421 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCRL2O00421 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCRL2O00421 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCRL2O00421 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCRL2O00421 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCRL2O00421 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCRL2O00421 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCRL2O00421 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCRL2O00421 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCRL2O00421 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCRL2O00421 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCRL2O00421 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCRL2O00421 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCRL2O00421 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCRL2O00421 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCRL2O00421 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCRL2O00421 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCRL2O00421 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCRL2O00421 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCRL2O00421 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCRL2O00421 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCRL2O00421 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCRL2O00421 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCRL2O00421 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCRL2O00421 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCRL2O00421 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCRL2O00421 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCRL2O00421 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCRL2O00421 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCRL2O00421 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCRL2O00421 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCRL2O00421 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCRL2O00421 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCRL2O00421 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCRL2O00421 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCRL2O00421 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCRL2O00421 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCRL2O00421 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCRL2O00421 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCRL2O00421 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCRL2O00421 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCRL2O00421 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCRL2O00421 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCRL2O00421 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCRL2O00421 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCRL2O00421 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCRL2O00421 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCRL2O00421 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCRL2O00421 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCRL2O00421 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCRL2O00421 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCRL2O00421 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCRL2O00421 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCRL2O00421 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCRL2O00421 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCRL2O00421 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCRL2O00421 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCRL2O00421 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCRL2O00421 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCRL2O00421 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCRL2O00421 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCRL2O00421 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCRL2O00421 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCRL2O00421 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCRL2O00421 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCRL2O00421 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCRL2O00421 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCRL2O00421 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCRL2O00421 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCRL2O00421 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCRL2O00421 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCRL2O00421 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCRL2O00421 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCRL2O00421 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCRL2O00421 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCRL2O00421 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCRL2O00421 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCRL2O00421 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCRL2O00421 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCRL2O00421 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCRL2O00421 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCRL2O00421 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCRL2O00421 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCRL2O00421 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCRL2O00421 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCRL2O00421 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCRL2O00421 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCRL2O00421 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCRL2O00421 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCRL2O00421 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCRL2O00421 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCRL2O00421 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCRL2O00421 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCRL2O00421 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCRL2O00421 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms