Protein–RNA interactions for Protein: H7C350

CCDC188, Coiled-coil domain-containing protein 188, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC188H7C350 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC188H7C350 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC188H7C350 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC188H7C350 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC188H7C350 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC188H7C350 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC188H7C350 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC188H7C350 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC188H7C350 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC188H7C350 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC188H7C350 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC188H7C350 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC188H7C350 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC188H7C350 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC188H7C350 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC188H7C350 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC188H7C350 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC188H7C350 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC188H7C350 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC188H7C350 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC188H7C350 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC188H7C350 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC188H7C350 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC188H7C350 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC188H7C350 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC188H7C350 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC188H7C350 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC188H7C350 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC188H7C350 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC188H7C350 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC188H7C350 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC188H7C350 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC188H7C350 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC188H7C350 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC188H7C350 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC188H7C350 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC188H7C350 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC188H7C350 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC188H7C350 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC188H7C350 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC188H7C350 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC188H7C350 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC188H7C350 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC188H7C350 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC188H7C350 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC188H7C350 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC188H7C350 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC188H7C350 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC188H7C350 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC188H7C350 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC188H7C350 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC188H7C350 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC188H7C350 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC188H7C350 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC188H7C350 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC188H7C350 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC188H7C350 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC188H7C350 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC188H7C350 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC188H7C350 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC188H7C350 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC188H7C350 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC188H7C350 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC188H7C350 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC188H7C350 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC188H7C350 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC188H7C350 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC188H7C350 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC188H7C350 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC188H7C350 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC188H7C350 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC188H7C350 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC188H7C350 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC188H7C350 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC188H7C350 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC188H7C350 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC188H7C350 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC188H7C350 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC188H7C350 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC188H7C350 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC188H7C350 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC188H7C350 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC188H7C350 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC188H7C350 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC188H7C350 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC188H7C350 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC188H7C350 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC188H7C350 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC188H7C350 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC188H7C350 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC188H7C350 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC188H7C350 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC188H7C350 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC188H7C350 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC188H7C350 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC188H7C350 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC188H7C350 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC188H7C350 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC188H7C350 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC188H7C350 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms