Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCRIP1C9JLW8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCRIP1C9JLW8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCRIP1C9JLW8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCRIP1C9JLW8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCRIP1C9JLW8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCRIP1C9JLW8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCRIP1C9JLW8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCRIP1C9JLW8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCRIP1C9JLW8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCRIP1C9JLW8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCRIP1C9JLW8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCRIP1C9JLW8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCRIP1C9JLW8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCRIP1C9JLW8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCRIP1C9JLW8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCRIP1C9JLW8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCRIP1C9JLW8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCRIP1C9JLW8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCRIP1C9JLW8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MCRIP1C9JLW8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCRIP1C9JLW8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCRIP1C9JLW8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCRIP1C9JLW8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCRIP1C9JLW8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCRIP1C9JLW8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCRIP1C9JLW8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCRIP1C9JLW8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCRIP1C9JLW8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCRIP1C9JLW8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCRIP1C9JLW8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCRIP1C9JLW8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCRIP1C9JLW8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCRIP1C9JLW8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCRIP1C9JLW8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCRIP1C9JLW8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCRIP1C9JLW8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCRIP1C9JLW8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCRIP1C9JLW8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCRIP1C9JLW8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCRIP1C9JLW8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCRIP1C9JLW8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MCRIP1C9JLW8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCRIP1C9JLW8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCRIP1C9JLW8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCRIP1C9JLW8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCRIP1C9JLW8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCRIP1C9JLW8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCRIP1C9JLW8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCRIP1C9JLW8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCRIP1C9JLW8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCRIP1C9JLW8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MCRIP1C9JLW8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MCRIP1C9JLW8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCRIP1C9JLW8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCRIP1C9JLW8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MCRIP1C9JLW8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCRIP1C9JLW8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCRIP1C9JLW8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCRIP1C9JLW8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCRIP1C9JLW8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCRIP1C9JLW8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCRIP1C9JLW8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCRIP1C9JLW8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCRIP1C9JLW8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCRIP1C9JLW8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCRIP1C9JLW8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCRIP1C9JLW8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCRIP1C9JLW8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCRIP1C9JLW8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCRIP1C9JLW8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCRIP1C9JLW8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCRIP1C9JLW8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCRIP1C9JLW8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCRIP1C9JLW8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCRIP1C9JLW8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCRIP1C9JLW8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCRIP1C9JLW8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCRIP1C9JLW8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCRIP1C9JLW8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCRIP1C9JLW8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCRIP1C9JLW8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCRIP1C9JLW8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCRIP1C9JLW8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCRIP1C9JLW8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCRIP1C9JLW8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCRIP1C9JLW8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCRIP1C9JLW8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCRIP1C9JLW8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCRIP1C9JLW8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCRIP1C9JLW8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCRIP1C9JLW8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCRIP1C9JLW8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCRIP1C9JLW8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCRIP1C9JLW8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCRIP1C9JLW8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCRIP1C9JLW8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCRIP1C9JLW8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCRIP1C9JLW8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MCRIP1C9JLW8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms