Protein–RNA interactions for Protein: C9JBD0

KRBOX1, KRAB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX1C9JBD0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRBOX1C9JBD0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRBOX1C9JBD0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRBOX1C9JBD0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRBOX1C9JBD0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRBOX1C9JBD0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRBOX1C9JBD0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRBOX1C9JBD0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRBOX1C9JBD0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRBOX1C9JBD0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRBOX1C9JBD0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRBOX1C9JBD0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRBOX1C9JBD0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRBOX1C9JBD0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRBOX1C9JBD0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRBOX1C9JBD0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRBOX1C9JBD0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRBOX1C9JBD0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRBOX1C9JBD0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRBOX1C9JBD0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRBOX1C9JBD0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRBOX1C9JBD0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRBOX1C9JBD0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRBOX1C9JBD0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRBOX1C9JBD0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRBOX1C9JBD0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRBOX1C9JBD0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRBOX1C9JBD0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRBOX1C9JBD0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRBOX1C9JBD0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRBOX1C9JBD0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRBOX1C9JBD0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRBOX1C9JBD0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRBOX1C9JBD0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRBOX1C9JBD0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRBOX1C9JBD0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRBOX1C9JBD0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRBOX1C9JBD0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRBOX1C9JBD0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRBOX1C9JBD0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRBOX1C9JBD0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRBOX1C9JBD0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRBOX1C9JBD0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRBOX1C9JBD0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRBOX1C9JBD0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRBOX1C9JBD0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRBOX1C9JBD0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRBOX1C9JBD0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRBOX1C9JBD0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRBOX1C9JBD0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRBOX1C9JBD0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRBOX1C9JBD0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRBOX1C9JBD0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRBOX1C9JBD0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRBOX1C9JBD0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRBOX1C9JBD0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRBOX1C9JBD0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRBOX1C9JBD0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRBOX1C9JBD0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRBOX1C9JBD0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRBOX1C9JBD0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRBOX1C9JBD0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRBOX1C9JBD0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRBOX1C9JBD0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRBOX1C9JBD0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRBOX1C9JBD0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRBOX1C9JBD0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRBOX1C9JBD0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRBOX1C9JBD0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRBOX1C9JBD0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRBOX1C9JBD0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRBOX1C9JBD0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRBOX1C9JBD0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRBOX1C9JBD0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRBOX1C9JBD0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRBOX1C9JBD0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRBOX1C9JBD0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRBOX1C9JBD0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRBOX1C9JBD0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRBOX1C9JBD0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRBOX1C9JBD0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRBOX1C9JBD0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRBOX1C9JBD0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRBOX1C9JBD0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRBOX1C9JBD0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRBOX1C9JBD0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRBOX1C9JBD0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRBOX1C9JBD0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRBOX1C9JBD0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRBOX1C9JBD0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRBOX1C9JBD0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRBOX1C9JBD0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRBOX1C9JBD0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRBOX1C9JBD0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRBOX1C9JBD0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRBOX1C9JBD0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRBOX1C9JBD0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRBOX1C9JBD0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRBOX1C9JBD0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRBOX1C9JBD0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms