Protein–RNA interactions for Protein: A6NFE3

EFCAB10, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB10A6NFE3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EFCAB10A6NFE3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFCAB10A6NFE3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFCAB10A6NFE3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EFCAB10A6NFE3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB10A6NFE3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB10A6NFE3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB10A6NFE3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EFCAB10A6NFE3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EFCAB10A6NFE3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EFCAB10A6NFE3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EFCAB10A6NFE3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EFCAB10A6NFE3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EFCAB10A6NFE3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EFCAB10A6NFE3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EFCAB10A6NFE3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EFCAB10A6NFE3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EFCAB10A6NFE3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EFCAB10A6NFE3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EFCAB10A6NFE3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EFCAB10A6NFE3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EFCAB10A6NFE3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EFCAB10A6NFE3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EFCAB10A6NFE3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EFCAB10A6NFE3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EFCAB10A6NFE3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EFCAB10A6NFE3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EFCAB10A6NFE3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EFCAB10A6NFE3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EFCAB10A6NFE3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFCAB10A6NFE3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFCAB10A6NFE3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFCAB10A6NFE3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFCAB10A6NFE3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFCAB10A6NFE3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFCAB10A6NFE3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFCAB10A6NFE3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFCAB10A6NFE3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EFCAB10A6NFE3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EFCAB10A6NFE3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EFCAB10A6NFE3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFCAB10A6NFE3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFCAB10A6NFE3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
EFCAB10A6NFE3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFCAB10A6NFE3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFCAB10A6NFE3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFCAB10A6NFE3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFCAB10A6NFE3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFCAB10A6NFE3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFCAB10A6NFE3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EFCAB10A6NFE3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFCAB10A6NFE3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFCAB10A6NFE3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFCAB10A6NFE3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFCAB10A6NFE3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFCAB10A6NFE3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFCAB10A6NFE3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFCAB10A6NFE3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFCAB10A6NFE3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFCAB10A6NFE3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EFCAB10A6NFE3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EFCAB10A6NFE3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EFCAB10A6NFE3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFCAB10A6NFE3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFCAB10A6NFE3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFCAB10A6NFE3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EFCAB10A6NFE3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EFCAB10A6NFE3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EFCAB10A6NFE3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EFCAB10A6NFE3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFCAB10A6NFE3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFCAB10A6NFE3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFCAB10A6NFE3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFCAB10A6NFE3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFCAB10A6NFE3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFCAB10A6NFE3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFCAB10A6NFE3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EFCAB10A6NFE3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EFCAB10A6NFE3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFCAB10A6NFE3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EFCAB10A6NFE3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EFCAB10A6NFE3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFCAB10A6NFE3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFCAB10A6NFE3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFCAB10A6NFE3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EFCAB10A6NFE3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EFCAB10A6NFE3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EFCAB10A6NFE3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EFCAB10A6NFE3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFCAB10A6NFE3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFCAB10A6NFE3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EFCAB10A6NFE3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFCAB10A6NFE3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFCAB10A6NFE3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFCAB10A6NFE3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFCAB10A6NFE3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB10A6NFE3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EFCAB10A6NFE3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFCAB10A6NFE3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EFCAB10A6NFE3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms