Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GOLGA6L9A6NEM1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
GOLGA6L9A6NEM1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GOLGA6L9A6NEM1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GOLGA6L9A6NEM1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GOLGA6L9A6NEM1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GOLGA6L9A6NEM1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GOLGA6L9A6NEM1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GOLGA6L9A6NEM1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GOLGA6L9A6NEM1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GOLGA6L9A6NEM1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GOLGA6L9A6NEM1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GOLGA6L9A6NEM1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GOLGA6L9A6NEM1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GOLGA6L9A6NEM1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GOLGA6L9A6NEM1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GOLGA6L9A6NEM1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GOLGA6L9A6NEM1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
GOLGA6L9A6NEM1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GOLGA6L9A6NEM1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GOLGA6L9A6NEM1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GOLGA6L9A6NEM1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GOLGA6L9A6NEM1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
GOLGA6L9A6NEM1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GOLGA6L9A6NEM1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GOLGA6L9A6NEM1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GOLGA6L9A6NEM1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GOLGA6L9A6NEM1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GOLGA6L9A6NEM1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GOLGA6L9A6NEM1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GOLGA6L9A6NEM1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
GOLGA6L9A6NEM1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GOLGA6L9A6NEM1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GOLGA6L9A6NEM1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GOLGA6L9A6NEM1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GOLGA6L9A6NEM1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
GOLGA6L9A6NEM1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GOLGA6L9A6NEM1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GOLGA6L9A6NEM1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GOLGA6L9A6NEM1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GOLGA6L9A6NEM1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GOLGA6L9A6NEM1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GOLGA6L9A6NEM1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
GOLGA6L9A6NEM1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GOLGA6L9A6NEM1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GOLGA6L9A6NEM1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GOLGA6L9A6NEM1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GOLGA6L9A6NEM1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GOLGA6L9A6NEM1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GOLGA6L9A6NEM1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GOLGA6L9A6NEM1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GOLGA6L9A6NEM1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GOLGA6L9A6NEM1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GOLGA6L9A6NEM1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GOLGA6L9A6NEM1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GOLGA6L9A6NEM1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GOLGA6L9A6NEM1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GOLGA6L9A6NEM1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GOLGA6L9A6NEM1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GOLGA6L9A6NEM1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GOLGA6L9A6NEM1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GOLGA6L9A6NEM1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GOLGA6L9A6NEM1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GOLGA6L9A6NEM1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GOLGA6L9A6NEM1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GOLGA6L9A6NEM1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
GOLGA6L9A6NEM1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GOLGA6L9A6NEM1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GOLGA6L9A6NEM1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GOLGA6L9A6NEM1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GOLGA6L9A6NEM1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GOLGA6L9A6NEM1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GOLGA6L9A6NEM1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GOLGA6L9A6NEM1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GOLGA6L9A6NEM1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GOLGA6L9A6NEM1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GOLGA6L9A6NEM1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GOLGA6L9A6NEM1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GOLGA6L9A6NEM1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GOLGA6L9A6NEM1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GOLGA6L9A6NEM1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
GOLGA6L9A6NEM1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GOLGA6L9A6NEM1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
GOLGA6L9A6NEM1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GOLGA6L9A6NEM1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GOLGA6L9A6NEM1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GOLGA6L9A6NEM1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GOLGA6L9A6NEM1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GOLGA6L9A6NEM1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GOLGA6L9A6NEM1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GOLGA6L9A6NEM1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GOLGA6L9A6NEM1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GOLGA6L9A6NEM1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GOLGA6L9A6NEM1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GOLGA6L9A6NEM1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms