Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPF3

DUXB, Double homeobox B, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUXBA0A1W2PPF3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUXBA0A1W2PPF3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUXBA0A1W2PPF3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUXBA0A1W2PPF3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUXBA0A1W2PPF3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUXBA0A1W2PPF3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUXBA0A1W2PPF3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUXBA0A1W2PPF3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUXBA0A1W2PPF3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUXBA0A1W2PPF3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUXBA0A1W2PPF3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUXBA0A1W2PPF3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUXBA0A1W2PPF3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUXBA0A1W2PPF3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DUXBA0A1W2PPF3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUXBA0A1W2PPF3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUXBA0A1W2PPF3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUXBA0A1W2PPF3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUXBA0A1W2PPF3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUXBA0A1W2PPF3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUXBA0A1W2PPF3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUXBA0A1W2PPF3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUXBA0A1W2PPF3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUXBA0A1W2PPF3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUXBA0A1W2PPF3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUXBA0A1W2PPF3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUXBA0A1W2PPF3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUXBA0A1W2PPF3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUXBA0A1W2PPF3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUXBA0A1W2PPF3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DUXBA0A1W2PPF3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUXBA0A1W2PPF3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUXBA0A1W2PPF3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUXBA0A1W2PPF3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUXBA0A1W2PPF3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUXBA0A1W2PPF3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUXBA0A1W2PPF3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUXBA0A1W2PPF3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUXBA0A1W2PPF3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUXBA0A1W2PPF3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUXBA0A1W2PPF3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUXBA0A1W2PPF3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUXBA0A1W2PPF3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUXBA0A1W2PPF3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUXBA0A1W2PPF3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUXBA0A1W2PPF3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUXBA0A1W2PPF3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DUXBA0A1W2PPF3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUXBA0A1W2PPF3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUXBA0A1W2PPF3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUXBA0A1W2PPF3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUXBA0A1W2PPF3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUXBA0A1W2PPF3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUXBA0A1W2PPF3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUXBA0A1W2PPF3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUXBA0A1W2PPF3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUXBA0A1W2PPF3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DUXBA0A1W2PPF3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUXBA0A1W2PPF3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUXBA0A1W2PPF3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUXBA0A1W2PPF3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUXBA0A1W2PPF3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUXBA0A1W2PPF3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUXBA0A1W2PPF3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUXBA0A1W2PPF3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUXBA0A1W2PPF3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUXBA0A1W2PPF3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUXBA0A1W2PPF3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUXBA0A1W2PPF3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUXBA0A1W2PPF3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUXBA0A1W2PPF3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUXBA0A1W2PPF3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUXBA0A1W2PPF3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUXBA0A1W2PPF3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUXBA0A1W2PPF3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUXBA0A1W2PPF3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUXBA0A1W2PPF3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUXBA0A1W2PPF3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUXBA0A1W2PPF3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DUXBA0A1W2PPF3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUXBA0A1W2PPF3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUXBA0A1W2PPF3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUXBA0A1W2PPF3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUXBA0A1W2PPF3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUXBA0A1W2PPF3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUXBA0A1W2PPF3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUXBA0A1W2PPF3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUXBA0A1W2PPF3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUXBA0A1W2PPF3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUXBA0A1W2PPF3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUXBA0A1W2PPF3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUXBA0A1W2PPF3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUXBA0A1W2PPF3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUXBA0A1W2PPF3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUXBA0A1W2PPF3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUXBA0A1W2PPF3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUXBA0A1W2PPF3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUXBA0A1W2PPF3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUXBA0A1W2PPF3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUXBA0A1W2PPF3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms