Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YX44

TRBV5-5, T-cell receptor beta variable 5-5 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-5A0A0J9YX44 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRBV5-5A0A0J9YX44 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRBV5-5A0A0J9YX44 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRBV5-5A0A0J9YX44 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRBV5-5A0A0J9YX44 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRBV5-5A0A0J9YX44 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRBV5-5A0A0J9YX44 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRBV5-5A0A0J9YX44 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRBV5-5A0A0J9YX44 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRBV5-5A0A0J9YX44 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRBV5-5A0A0J9YX44 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRBV5-5A0A0J9YX44 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRBV5-5A0A0J9YX44 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRBV5-5A0A0J9YX44 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRBV5-5A0A0J9YX44 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRBV5-5A0A0J9YX44 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRBV5-5A0A0J9YX44 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRBV5-5A0A0J9YX44 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRBV5-5A0A0J9YX44 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRBV5-5A0A0J9YX44 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRBV5-5A0A0J9YX44 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRBV5-5A0A0J9YX44 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRBV5-5A0A0J9YX44 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRBV5-5A0A0J9YX44 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRBV5-5A0A0J9YX44 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRBV5-5A0A0J9YX44 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRBV5-5A0A0J9YX44 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRBV5-5A0A0J9YX44 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRBV5-5A0A0J9YX44 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRBV5-5A0A0J9YX44 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRBV5-5A0A0J9YX44 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRBV5-5A0A0J9YX44 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRBV5-5A0A0J9YX44 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRBV5-5A0A0J9YX44 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRBV5-5A0A0J9YX44 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRBV5-5A0A0J9YX44 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRBV5-5A0A0J9YX44 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRBV5-5A0A0J9YX44 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRBV5-5A0A0J9YX44 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRBV5-5A0A0J9YX44 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRBV5-5A0A0J9YX44 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRBV5-5A0A0J9YX44 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRBV5-5A0A0J9YX44 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRBV5-5A0A0J9YX44 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRBV5-5A0A0J9YX44 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRBV5-5A0A0J9YX44 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRBV5-5A0A0J9YX44 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRBV5-5A0A0J9YX44 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRBV5-5A0A0J9YX44 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRBV5-5A0A0J9YX44 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRBV5-5A0A0J9YX44 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRBV5-5A0A0J9YX44 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRBV5-5A0A0J9YX44 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRBV5-5A0A0J9YX44 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRBV5-5A0A0J9YX44 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRBV5-5A0A0J9YX44 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRBV5-5A0A0J9YX44 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRBV5-5A0A0J9YX44 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRBV5-5A0A0J9YX44 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRBV5-5A0A0J9YX44 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRBV5-5A0A0J9YX44 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRBV5-5A0A0J9YX44 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRBV5-5A0A0J9YX44 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRBV5-5A0A0J9YX44 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRBV5-5A0A0J9YX44 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRBV5-5A0A0J9YX44 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRBV5-5A0A0J9YX44 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRBV5-5A0A0J9YX44 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRBV5-5A0A0J9YX44 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRBV5-5A0A0J9YX44 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRBV5-5A0A0J9YX44 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRBV5-5A0A0J9YX44 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRBV5-5A0A0J9YX44 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRBV5-5A0A0J9YX44 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRBV5-5A0A0J9YX44 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRBV5-5A0A0J9YX44 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRBV5-5A0A0J9YX44 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRBV5-5A0A0J9YX44 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRBV5-5A0A0J9YX44 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRBV5-5A0A0J9YX44 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRBV5-5A0A0J9YX44 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRBV5-5A0A0J9YX44 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRBV5-5A0A0J9YX44 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRBV5-5A0A0J9YX44 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRBV5-5A0A0J9YX44 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRBV5-5A0A0J9YX44 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRBV5-5A0A0J9YX44 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRBV5-5A0A0J9YX44 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRBV5-5A0A0J9YX44 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRBV5-5A0A0J9YX44 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRBV5-5A0A0J9YX44 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRBV5-5A0A0J9YX44 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRBV5-5A0A0J9YX44 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRBV5-5A0A0J9YX44 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TRBV5-5A0A0J9YX44 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRBV5-5A0A0J9YX44 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRBV5-5A0A0J9YX44 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRBV5-5A0A0J9YX44 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRBV5-5A0A0J9YX44 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRBV5-5A0A0J9YX44 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms