Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1R7

BORCS7-ASMT, BORCS7-ASMT readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms