Protein–RNA interactions for Protein: A0A088AWK7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A088AWK7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A088AWK7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A088AWK7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
A0A088AWK7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A088AWK7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A088AWK7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
A0A088AWK7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A088AWK7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A088AWK7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A088AWK7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A088AWK7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A088AWK7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A088AWK7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A088AWK7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A088AWK7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A088AWK7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A088AWK7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A088AWK7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A088AWK7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A088AWK7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A088AWK7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A088AWK7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A088AWK7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
A0A088AWK7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A088AWK7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A088AWK7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A088AWK7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A088AWK7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A088AWK7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A088AWK7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A088AWK7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A088AWK7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A088AWK7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A088AWK7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A088AWK7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
A0A088AWK7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
A0A088AWK7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
A0A088AWK7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A088AWK7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A088AWK7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A088AWK7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
A0A088AWK7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
A0A088AWK7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
A0A088AWK7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
A0A088AWK7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A088AWK7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A088AWK7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A088AWK7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A088AWK7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A088AWK7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A088AWK7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A088AWK7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A088AWK7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A088AWK7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A088AWK7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A088AWK7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A088AWK7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A088AWK7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A088AWK7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A088AWK7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A088AWK7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A088AWK7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
A0A088AWK7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A088AWK7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A088AWK7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A088AWK7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A088AWK7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A088AWK7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A088AWK7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A088AWK7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A088AWK7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A088AWK7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A088AWK7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A088AWK7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A088AWK7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A088AWK7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A088AWK7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A088AWK7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A088AWK7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A088AWK7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A088AWK7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A088AWK7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A088AWK7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
A0A088AWK7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A088AWK7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A088AWK7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A088AWK7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A088AWK7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A088AWK7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A088AWK7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A088AWK7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
A0A088AWK7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
A0A088AWK7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
A0A088AWK7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
A0A088AWK7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
A0A088AWK7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A088AWK7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A088AWK7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A088AWK7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
A0A088AWK7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms