Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WXM9

MEIKIN, Meiosis-specific kinetochore protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIKINA0A087WXM9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MEIKINA0A087WXM9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MEIKINA0A087WXM9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEIKINA0A087WXM9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MEIKINA0A087WXM9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MEIKINA0A087WXM9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MEIKINA0A087WXM9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MEIKINA0A087WXM9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEIKINA0A087WXM9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEIKINA0A087WXM9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MEIKINA0A087WXM9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MEIKINA0A087WXM9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEIKINA0A087WXM9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEIKINA0A087WXM9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MEIKINA0A087WXM9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MEIKINA0A087WXM9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MEIKINA0A087WXM9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MEIKINA0A087WXM9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MEIKINA0A087WXM9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MEIKINA0A087WXM9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MEIKINA0A087WXM9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MEIKINA0A087WXM9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIKINA0A087WXM9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIKINA0A087WXM9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIKINA0A087WXM9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIKINA0A087WXM9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEIKINA0A087WXM9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEIKINA0A087WXM9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEIKINA0A087WXM9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MEIKINA0A087WXM9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MEIKINA0A087WXM9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEIKINA0A087WXM9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEIKINA0A087WXM9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEIKINA0A087WXM9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEIKINA0A087WXM9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEIKINA0A087WXM9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEIKINA0A087WXM9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEIKINA0A087WXM9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEIKINA0A087WXM9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEIKINA0A087WXM9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEIKINA0A087WXM9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEIKINA0A087WXM9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEIKINA0A087WXM9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEIKINA0A087WXM9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIKINA0A087WXM9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIKINA0A087WXM9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIKINA0A087WXM9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIKINA0A087WXM9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIKINA0A087WXM9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIKINA0A087WXM9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEIKINA0A087WXM9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEIKINA0A087WXM9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIKINA0A087WXM9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIKINA0A087WXM9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIKINA0A087WXM9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIKINA0A087WXM9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEIKINA0A087WXM9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEIKINA0A087WXM9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEIKINA0A087WXM9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEIKINA0A087WXM9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEIKINA0A087WXM9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEIKINA0A087WXM9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEIKINA0A087WXM9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEIKINA0A087WXM9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEIKINA0A087WXM9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEIKINA0A087WXM9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEIKINA0A087WXM9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEIKINA0A087WXM9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEIKINA0A087WXM9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEIKINA0A087WXM9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEIKINA0A087WXM9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIKINA0A087WXM9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIKINA0A087WXM9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MEIKINA0A087WXM9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIKINA0A087WXM9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIKINA0A087WXM9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIKINA0A087WXM9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIKINA0A087WXM9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIKINA0A087WXM9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEIKINA0A087WXM9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIKINA0A087WXM9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIKINA0A087WXM9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIKINA0A087WXM9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIKINA0A087WXM9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIKINA0A087WXM9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIKINA0A087WXM9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIKINA0A087WXM9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEIKINA0A087WXM9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEIKINA0A087WXM9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIKINA0A087WXM9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIKINA0A087WXM9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIKINA0A087WXM9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIKINA0A087WXM9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEIKINA0A087WXM9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEIKINA0A087WXM9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEIKINA0A087WXM9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEIKINA0A087WXM9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIKINA0A087WXM9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIKINA0A087WXM9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIKINA0A087WXM9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms