Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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