Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms