Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms