Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms