Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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ATP2A3Q93084 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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ATP2A3Q93084 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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ATP2A3Q93084 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP2A3Q93084 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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