Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HS2ST1Q7LGA3 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms