Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 MIR7847-201ENST00000610912 103 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
FAM208BQ5VWN6 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 SERPINB8-209ENST00000636430 1719 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 CSMD2-202ENST00000338325 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 AL133517.1-201ENST00000413412 748 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 AL121983.2-204ENST00000430592 448 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 AC002066.1-201ENST00000446355 514 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 TRIQK-213ENST00000521617 774 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 AC073578.1-201ENST00000535133 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 AC063924.1-201ENST00000546680 673 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 AC025259.1-201ENST00000550301 647 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 CTBP2P7-201ENST00000593270 1244 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 AC022150.2-201ENST00000596451 644 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 AC083841.4-201ENST00000637396 352 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 MKL1-213ENST00000620651 3757 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 MEG3-214ENST00000519709 1726 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 DHRS1-202ENST00000396813 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 ANKDD1A-207ENST00000496660 1477 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 KIAA0391-211ENST00000605870 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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FAM208BQ5VWN6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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FAM208BQ5VWN6 ANXA3-209ENST00000512884 1335 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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FAM208BQ5VWN6 AC096536.3-201ENST00000415336 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 LINC00313-206ENST00000441283 448 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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FAM208BQ5VWN6 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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FAM208BQ5VWN6 LINC02328-202ENST00000554647 522 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 AC103740.2-201ENST00000557900 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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FAM208BQ5VWN6 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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FAM208BQ5VWN6 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 TMEM176A-201ENST00000004103 1261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 RPL10P12-201ENST00000427342 318 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 AC023157.1-201ENST00000453713 402 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 AP000763.1-201ENST00000539481 325 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 ALOX12P1-201ENST00000579299 1229 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 PRL-203ENST00000617911 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM208BQ5VWN6 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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