Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 CPT1C-203ENST00000392518 2910 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 SLC38A1-202ENST00000439706 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 PITRM1-201ENST00000224949 3450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 TMPRSS7-201ENST00000419127 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 TBC1D29-202ENST00000580161 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 USP30-201ENST00000257548 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 NLRP2-206ENST00000427260 3411 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 ABCB9-211ENST00000540285 3330 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 WT1-AS-201ENST00000395900 3828 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 WBP1L-202ENST00000448841 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 NUP62-208ENST00000596217 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 ABCA3-201ENST00000301732 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 FAM184A-211ENST00000521531 3244 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 PDP1-202ENST00000396200 4358 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 HPSE2-202ENST00000370549 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AL391294.1-201ENST00000641352 4068 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 CCDC148-201ENST00000283233 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 PCDHA10-202ENST00000506939 3788 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 BAIAP3-215ENST00000568887 3763 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 ZNF606-201ENST00000341164 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms