Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 AC007389.3-201ENST00000420724 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 CA6-201ENST00000377436 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 CA6-202ENST00000377442 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 AC246787.2-202ENST00000418566 370 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 H1FOO-202ENST00000503977 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 THEG-204ENST00000530711 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 AC010319.2-201ENST00000594663 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AC024475.2-201ENST00000312173 879 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 KRTAP10-11-201ENST00000334670 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 SNORA30.1-201ENST00000363193 129 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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PTCH1Q13635 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AC005332.2-201ENST00000590010 930 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 TRPC5OS-203ENST00000635763 955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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PTCH1Q13635 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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PTCH1Q13635 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 TRBV11-2-201ENST00000471935 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 RN7SL479P-201ENST00000472003 300 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AL450346.2-201ENST00000495602 1024 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 EFNA5-204ENST00000509503 637 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AC100858.2-201ENST00000531948 487 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 IL32-230ENST00000551122 733 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AC027682.3-201ENST00000564717 207 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 RN7SL202P-201ENST00000584410 262 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 MXRA7-204ENST00000585519 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms