Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MMP13P45452 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MMP13P45452 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MMP13P45452 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MMP13P45452 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MMP13P45452 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MMP13P45452 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MMP13P45452 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MMP13P45452 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MMP13P45452 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MMP13P45452 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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