Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms