Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 CEACAM20-203ENST00000614924 1809 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 AL132642.2-201ENST00000623423 1998 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 NLRP7-201ENST00000328092 3299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 AL354861.3-201ENST00000600140 2412 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 CHRNA7-223ENST00000637033 3204 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 MFSD11-201ENST00000336509 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 LINC00685-201ENST00000391707 428 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 GNPDA1-210ENST00000508177 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 CPT1C-217ENST00000598293 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 KCTD21-AS1-207ENST00000600795 1549 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms