Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP13Q92995 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP13Q92995 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP13Q92995 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP13Q92995 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP13Q92995 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP13Q92995 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP13Q92995 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP13Q92995 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP13Q92995 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP13Q92995 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP13Q92995 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP13Q92995 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP13Q92995 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP13Q92995 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP13Q92995 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
USP13Q92995 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP13Q92995 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
USP13Q92995 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP13Q92995 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP13Q92995 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP13Q92995 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP13Q92995 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP13Q92995 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP13Q92995 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP13Q92995 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
USP13Q92995 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP13Q92995 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP13Q92995 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP13Q92995 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP13Q92995 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP13Q92995 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP13Q92995 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP13Q92995 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
USP13Q92995 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP13Q92995 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP13Q92995 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP13Q92995 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP13Q92995 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP13Q92995 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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