Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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