Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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FAM3AP98173 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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FAM3AP98173 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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FAM3AP98173 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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FAM3AP98173 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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FAM3AP98173 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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