Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 EDRF1-201ENST00000337623 4387 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 MOG-225ENST00000431798 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 UBXN4-201ENST00000272638 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 MAP10-201ENST00000418460 3516 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 WDR37-201ENST00000263150 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 LINC01254-201ENST00000566225 2908 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 C19orf44-201ENST00000221671 3427 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 SMIM10L1-201ENST00000622602 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 CNTROB-201ENST00000380262 3769 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 CYP1A2-201ENST00000343932 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 TSPYL2-201ENST00000375442 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 POLN-201ENST00000382865 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 UBE2L3-201ENST00000342192 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 GNG11-201ENST00000248564 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 NFATC1-202ENST00000318065 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 CCNA1-201ENST00000255465 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 PECR-201ENST00000265322 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 WASF3-201ENST00000335327 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 TLE3-222ENST00000560589 3509 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 PCDHB7-201ENST00000231137 3765 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 BTBD11-202ENST00000357167 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 CELF2-AS1-201ENST00000379256 2468 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 LIN28B-203ENST00000637759 2635 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 UBIAD1-202ENST00000376810 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 IL17REL-202ENST00000389983 3668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 SERP1-203ENST00000479209 3934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 DENND4C-205ENST00000434457 6718 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 WASHC5-201ENST00000318410 4187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 ZSCAN30-202ENST00000420878 4323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 CHCHD7-201ENST00000303759 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 RAET1K-202ENST00000533735 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 ZMYM5-201ENST00000337963 3268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 NR2F1-AS1-213ENST00000607797 3380 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 ARHGAP27-212ENST00000532038 3694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 COL20A1-201ENST00000358894 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX1P83916 ABCC3-201ENST00000285238 5716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 RTEL1-211ENST00000508582 4273 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX1P83916 RP2-201ENST00000218340 3803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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