Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 KCNQ3-201ENST00000388996 11510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 TLK1-205ENST00000431350 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 COL19A1-205ENST00000620364 6233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 RNF150-206ENST00000515673 9805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 HERC2P9-206ENST00000529624 5187 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 IL21R-201ENST00000337929 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PNPO-217ENST00000642017 3465 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 MKL1-205ENST00000407029 4091 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 CCDC14-220ENST00000488653 4156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 SMIM10L1-201ENST00000622602 4795 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms