Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CT47B1P0C2W7 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CT47B1P0C2W7 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms