Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 RN7SL479P-201ENST00000472003 300 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AC008021.1-201ENST00000474180 414 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AC099343.1-201ENST00000513481 609 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AC126177.4-201ENST00000547452 731 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AC091691.1-201ENST00000583587 1018 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AC008555.6-201ENST00000605047 458 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AC092687.3-201ENST00000606907 393 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 PILRB-213ENST00000609309 993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 SUCLG2-203ENST00000492795 1512 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AP000787.1-205ENST00000536683 1485 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 IGHE-202ENST00000641420 1485 ntAPPRIS P5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 SLC36A1-211ENST00000616007 1389 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 U3.41-201ENST00000408711 219 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AL133351.2-201ENST00000437718 484 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 SOX2-OT-203ENST00000466034 926 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 SOX2-OT-221ENST00000594942 675 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AL157832.2-205ENST00000597245 1649 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 416 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 MIR181D-201ENST00000384853 137 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 GSG1L2-201ENST00000399363 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AC074019.1-201ENST00000428788 1096 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 PRSS45-201ENST00000442359 687 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 RN7SL677P-201ENST00000466970 319 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 FTH1-205ENST00000529631 507 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 THEG-204ENST00000530711 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AC025265.3-201ENST00000550175 468 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 PPY-202ENST00000587006 431 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AC022382.1-201ENST00000602768 336 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 GLB1-203ENST00000399402 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 RN7SKP255-201ENST00000363442 313 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 RN7SKP203-201ENST00000363618 332 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 RN7SKP71-201ENST00000364558 318 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 7SK.1-201ENST00000365328 331 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 NPPB-201ENST00000376468 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 ASPDH-201ENST00000376916 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 Metazoa_SRP.8-201ENST00000398067 251 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AC067942.1-202ENST00000471756 1057 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 IL32-230ENST00000551122 733 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AL583722.3-201ENST00000553433 503 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AC104759.1-201ENST00000559109 939 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AC027228.1-201ENST00000560094 325 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 CD276-217ENST00000564751 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AC010601.2-201ENST00000623060 774 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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