Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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HOXA3O43365 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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HOXA3O43365 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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HOXA3O43365 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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HOXA3O43365 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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HOXA3O43365 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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HOXA3O43365 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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HOXA3O43365 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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HOXA3O43365 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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HOXA3O43365 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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