Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms