Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM47Q96LD4 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms