Protein–RNA interactions for Protein: P63279

UBE2I, SUMO-conjugating enzyme UBC9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2IP63279 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2IP63279 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms