Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms