Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL23P55773 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL23P55773 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL23P55773 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL23P55773 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL23P55773 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL23P55773 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL23P55773 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL23P55773 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL23P55773 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL23P55773 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL23P55773 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL23P55773 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL23P55773 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL23P55773 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL23P55773 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL23P55773 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL23P55773 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL23P55773 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCL23P55773 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCL23P55773 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCL23P55773 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCL23P55773 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCL23P55773 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCL23P55773 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCL23P55773 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCL23P55773 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCL23P55773 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCL23P55773 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCL23P55773 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCL23P55773 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCL23P55773 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CCL23P55773 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCL23P55773 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCL23P55773 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCL23P55773 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CCL23P55773 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCL23P55773 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCL23P55773 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCL23P55773 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCL23P55773 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCL23P55773 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCL23P55773 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCL23P55773 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCL23P55773 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCL23P55773 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCL23P55773 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCL23P55773 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCL23P55773 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CCL23P55773 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCL23P55773 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCL23P55773 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCL23P55773 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCL23P55773 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCL23P55773 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms