Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD4P46934 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms