Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF9P41273 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFSF9P41273 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF9P41273 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF9P41273 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF9P41273 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF9P41273 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF9P41273 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF9P41273 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF9P41273 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF9P41273 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF9P41273 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF9P41273 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF9P41273 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF9P41273 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF9P41273 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF9P41273 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF9P41273 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF9P41273 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF9P41273 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF9P41273 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF9P41273 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFSF9P41273 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms