Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms