Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTMAP06454 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTMAP06454 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTMAP06454 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTMAP06454 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTMAP06454 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTMAP06454 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTMAP06454 PIWIL1-201ENST00000245255 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTMAP06454 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 CARD14-209ENST00000573882 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 COL12A1-202ENST00000345356 5886 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 EBF1-201ENST00000313708 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 PCDHGA6-201ENST00000517434 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 COL19A1-205ENST00000620364 6233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 ZNF667-201ENST00000292069 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 PPIL2-201ENST00000335025 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 ATAD2-201ENST00000287394 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 CCDC144A-204ENST00000360524 5830 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTMAP06454 GRM4-206ENST00000544773 2983 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTMAP06454 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTMAP06454 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTMAP06454 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTMAP06454 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTMAP06454 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTMAP06454 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTMAP06454 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTMAP06454 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTMAP06454 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTMAP06454 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTMAP06454 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTMAP06454 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTMAP06454 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTMAP06454 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTMAP06454 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTMAP06454 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTMAP06454 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTMAP06454 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTMAP06454 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTMAP06454 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTMAP06454 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTMAP06454 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTMAP06454 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTMAP06454 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTMAP06454 OR1I1-202ENST00000641398 5984 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTMAP06454 RAP1A-202ENST00000369709 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTMAP06454 CAPN10-AS1-201ENST00000567819 4000 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTMAP06454 CPNE4-201ENST00000429747 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTMAP06454 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTMAP06454 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTMAP06454 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTMAP06454 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTMAP06454 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTMAP06454 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTMAP06454 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTMAP06454 TG-201ENST00000220616 8450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTMAP06454 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTMAP06454 GRIK5-202ENST00000301218 3310 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTMAP06454 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTMAP06454 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTMAP06454 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTMAP06454 PRRC2A-202ENST00000376033 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTMAP06454 SMG6-201ENST00000263073 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms