Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms