Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms