Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLKQ9UBT6 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms